Workshops

Referentinnen: Prof. Ursula Arning, Leitung Open Science, ZB MED / Petra Labriga, Leitung Strategisches Lizenzmanagement, ZB MED

Teilnahmegebühr: 15 EUR

Was bedeutet die Transformation des wissenschaftlichen Publizierens für Medizinbibliotheken?

In einem kurzen Impulsvortrag wird das Papier des Wissenschaftsrats „Empfehlungen zur Transformation des wissenschaftlichen Publizierens zu Open Access“ vorgestellt, mit speziellem Fokus auf die Transformation vom Subskriptionsmodell hin zu Open Access. Anschließend sind alle Teilnehmenden eingeladen zur gemeinsamen Reflexion und Diskussion:

Was bedeutet die Transformation hin zu einem Informationsbudget für die tägliche Praxis in medizinischen Bibliotheken? Gibt es schon Pläne in den Einrichtungen, diese umzusetzen?

Diese Überlegungen sollen abschließend die Rolle von ZB MED als Zentrale Fachbibliothek der Medizin aufgreifen und in ein mögliches Lastenheft Eingang finden, wie ZB MED Bibliotheken und Fach-Communitys bei dieser Transformation unterstützen kann.

Abstract in GMS Meetings

Referent*innen: Dr. Evamaria Krause, Universitätsbibliothek Augsburg, Teilbibliothek Medizin / Dr. Helge Knüttel, Universitätsbibliothek Regensburg, Teilbibliothek Medizin

Teilnahmegebühr: 15 EUR

Ziel dieses Workshops ist es, einen Einstieg in offene und reproduzierbare Arbeitsabläufe beim Umgang mit Daten zu vermitteln. Wir stellen dazu OpenRefine vor, ein leistungsstarkes, kostenloses Open-Source-Tool. OpenRefine ermöglicht es, mit großen Datensätzen zu arbeiten, sie zu verstehen und zu bereinigen. Alle Verarbeitungsschritte werden dabei dokumentiert, so dass Arbeitsabläufe repliziert und mit anderen geteilt werden können. Darüber hinaus bietet OpenRefine einen vergleichsweise niedrigschwelligen Einstieg in die Abfrage von Webservices, beispielsweise um eigene Datensätze anzureichern.

Im Workshop werden wir die grundlegenden Funktionen von OpenRefine vermitteln, wie Datenimport, Aufbau der Benutzeroberfläche, Facettierung und Filterung sowie das Rückgängigmachen und Wiederholen von Arbeitsschritten. Dann stellen wir GREL (General Refine Expression Language) vor, die Programmiersprache, die in OpenRefine zur Transformation von Daten verwendet wird. Im Anschluss werden wir in die Abfrage von Programmierschnittstellen (Application Programming Interfaces, APIs) einsteigen: Wie funktionieren sie und wie kann man sie in OpenRefine nutzen? Als Beispiele werden wir uns die CrossRef API und die E-utilities API des NCBI, ansehen. Wir werden mit bibliografischen Daten wissenschaftlicher Artikel arbeiten und zeigen, wie man Metadaten wie den Zeitschriftentitel oder die PubMed-ID auf der Grundlage eines DOI abfragen kann. Wir stellen auch vor, wie man ausgehend von PubMed-IDs die hinterlegten Publikationstypen, Affiliations oder Similar Articles abruft.  Am Ende werden wir kurz diskutieren, welche Anwendungsfälle die Teilnehmer*innen für ihre eigene Arbeit sehen.

Abstract in GMS Meetings